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G5U 超保真DNA聚合酶——DNA聚合酶的金标准!

(2023-9-18)

         G5U High-Fidelity DNA Polymerase,由HaiGene分子酶进化平台(in silico Design & invitro Evolution Workflow)筛选获得。该酶来源于高保真DNA聚合酶,并加入了增强的延伸结构,使其具有长片段扩增、高产能力。强压力筛选的外切活性区域(100xTaq酶保真度),使其具有超保真性能。底物活性中心的改造,使其具有dUTP渗入的能力、扩增含有尿嘧啶模板的能力。使用该酶可轻松扩增8kb的基因组DNA、20kb的λDNA。该酶具有2kb/min以上的延伸速度。该酶具有强3’-5’的外切酶活性,产物为平末端。
         许多有高保真功能的聚合酶来源为 B型 DNA 聚合酶,在遇到 DNA 模板中的尿嘧啶碱基时停止复制。 G5U删除了尿嘧啶结合域,使其能够读取和扩增含有尿嘧啶的模板,该性能赋予其独特的“U” 特征。该特征有两个重要的应用方向:(1)用于超保真扩增重亚硫酸氢盐转化、脱氨基、或受损DNA;(2)在超保真扩增中搭配dUTP和热敏UDG,用于防止PCR体系中携带污染。除此外,也多用于USER 克隆。
特征
  • 超保真扩增:与Q5同水平的保真性能(100xTaq酶保真度)。
  • 识别dUTP底物:能够读取和扩增含有尿嘧啶的模板,具有“U” 特征。
  • 防污染扩增:在PCR扩增中可用dUTP完全替代dTTP,建立防污染高保真扩增。
  • 长片段扩增:质粒、λDNA 等简单模板>20 kb,复杂基因组模板>8 kb。
功能测试
(该实验结果来自HaiGene实验室,未经允许,不得转载)

1.不同长度片段的扩增图(最高到20kb): 使用G5U HiFi DNA Polymerase以gDNA为模板进行扩增500bp-8kb的产物,以λDNA为模板扩增15-20kb的产物。酶的使用浓度为:0.02-0.04U/μl。

G5U超保真DNA聚合酶

2. 扩增dUTP能力测试:G重硫酸盐处理DNA后,未发生甲基化的C碱基转化为U碱基,使用G5U HiFi DNA Polymerase用于高保真扩增DNA甲基化实验,扩增产物为500bp,酶的工作浓度为0.04U/μl。

G5U超保真DNA聚合酶

3.不同酶量扩增效果:以gDNA为模板(2ng/μl)分别使用不同量的G5U扩增5kb的片段,如图所示在0.02U/μl的酶浓度下即可有效扩增。

G5U超保真DNA聚合酶

4. 扩增灵敏度展示:使用G5U HiFi DNA Polymerase以不同量的gDNA为模板扩增500bp的产物,如图所示该酶可扩增低至10pg的gDNA(约3-5个细胞),酶工作浓度为0.04U/μl。

G5U超保真DNA聚合酶

5. 保真度扩增实验:使用含不同保真度的DNA聚合酶的PCR Mix对DNA模板进行扩增35cycles后,进行NGS测序。结果表明:G5U HiFi DNA聚合酶具有最高的保真度,约是taq酶的105倍。

G5U超保真DNA聚合酶